Der Schwerpunkt von Prof. Bernd Bojahr liegt insbesondere auf der operativen minimal invasiven Therapie von gutartigen Genitalerkrankungen, einschließlich Erkrankungen des Beckenbodens.

Er ist seit 2002 in der Klinik für MIC tätig und ist dort Teamchef für Gynäkologie  sowie stellvertretender Leiter des zertifizierten Endometriosezentrums.

2010 erhielt er als erster Gynäkologe in Berlin die AGE Zertifizierung MIC III als chirurgische Qualifikation.